Kabubaten ini memiliki 610 pulau. Empat di antara nya, Yakni
Pulau Misool, Salawati Dan Waigeo, merupakan pulau-pulau besar.
Dari seluruh pulau hanya 35 yang berpenghuni sedangkan pulau
lainya tidak berpenghuni dan sebagian besar belum memiliki nama
Sebagai daerah kepulauan, satu-satunya transportasi antar pulau dan penunjang kegiatan masyarakat Raja Ampat adalah angkutan laut. Demikian juga untuk menjangkau Waisai, ibu kota kabubaten. Bila menggunakan pesawat udarah, lebih dulu menuju kota Sorong. setelah itu, dari Sorong perjalanan ke Waisai di lanjutkan dengan transportasi laut. Sarana yang tersedia adalah kapal cepat berkapasitas 10-30 orang. Dengan biaya sekitar Rp. 2 juta, Waisai dapat dijangkau dalam waktu 1,5 hingga 2 jam
Raja Ampat memiliki keindahan alam yang sangat bagus, raja ampat merupakan salah satu destinasi wisata yang sangat menarik
Berikut ini foto-foto keindahan Raja Ampat